Secara geografis Kabupaten Pamekasan yang merupakan bagian dari wilayah propinsi Jawa Timur terletak di sebelah timur Pulau Jawa pada salah satu Kabupaten dikawasan Pulau Madura memiliki luas 792,30 Km2, tepatnya pada koordinat 6°51 - 7°31 LS (Lintang Selatan) dan 113°19 - 113°58 BT (Bujur Timur).

Secara administrasi, Kabupaten Pamekasan terletak di :

• Wilayah Selatan berbatasan selat Madura
• Sebelah timur berbatasan Kabupaten Sumenep
• Utara berbatasan Laut Jawa
• Barat berbatasan Kabupaten Sampang.

Wilayah Yurisdiksi Pengadilan Negeri Kelas IB Pamekasan terdiri dari 13 Kecamatan yaitu :

1. Kecamatan Pamekasan

2. Kecamatan Tlanakan

3. Kecamatan Pademawu

4. Kecamatan Galis

5. Kecamatan Larangan

6. Kecamatan Kadur

7. Kecamatan Pakong

8. Kecamatan Waru

9. Kecamatan Pasean

10. Kecamatan Batu Marmar

11. Kecamatan Pegantenan

12. Kecamatan Palengaan

13. Kecamatan Proppo